本片是一部將偉大的搖滾樂隊披頭士的音樂和波普視覺藝術完美結合而成的二維插畫風格的動畫片，整部片子中共穿插了披頭士的15首經典歌曲。影片講述了披頭士成員保羅·麥卡特尼在半夢半醒之間來到花椒國，這是一個討厭音樂的地方，正遭遇藍色惡魔的侵略，老船長弗萊德召集披頭士成員一同乘坐黃色潛水艇共同保衛花椒國。 披頭士音樂貫穿整個影片中：影片開頭用George Martin（喬治·馬丁，披頭士音樂製作人）的絃樂描述祥和的花椒國，接著由Ringo Starr (林格·斯塔爾，披頭士鼓手)演唱的“黃色潛水艇”(Yellow Submarine)則象徵著花椒人民的朝氣蓬勃。然而好景不長，壞蛋藍心惡魔開始破壞花椒國的快樂與寧靜，老船長征召披頭士成員“一起來吧”(Come Together)，聯手抗擊藍心惡魔，披頭士成員裝扮成花椒軍士在“帕伯軍士孤獨之心俱樂部樂隊”(Sgt Peppers Lonely Heart Club Band)的音樂中擊潰了敵人，維護了他們的信念——“你需要的就是愛”（All You Need Is Love），拯救了花椒國。
